En 1999, 534 empresas agroalimentarias estaban certificadas de acuerdo con la ISO 9001 y 9002, lo que significa un incremento de 181 empresas respecto al ejercicio anterior, según el estudio "La industria alimentaria. Empresas certificadas ISO 9000" elaborado por la Subdirección General de Industrias Agroalimentarias del Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación. Estos datos reflejan, según el informe, "el interés real que tiene el sector por la calidad y más concretamente por asegurar la calidad a su cliente". El subsector que cuenta con un mayor número de empresas es el que corresponde a la Industra Cárnica (91), seguido por el de Preparación y Conservación de Frutas y Hortalizas (72) y el de Elaboración de Vinos (55). La Comunidad Autónoma que cuenta con mayor número de empresas certificadas es Cataluña con 103, seguida de Andalucía con 85 y de Valencia con 47.